Гниют перцы в сухую и жаркую погоду от недостатка влаги в почве. Это основная причина вершинной гнили плодов перца. Вторая причина — недостаток азота, хотя и она связана по большому счёту с недостатком влаги. Всё что нужно сделать, чтобы от неё избавиться, это хорошо полить и опрыскивать в последующие дни растения перцев водой. Так же желательно подкормить перцы раствором куриного помёта или любым жидким азотным удобрением, продающимся в садовых магазинах.
Если загнивание происходит в холодную и влажную погоду ближе к осени, то это естественный процесс отмирания, и по всем признакам пора собирать не дозревшие плоды в технической спелости, что бы не лишиться урожая совсем.